Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL28P46779 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL28P46779 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL28P46779 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL28P46779 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL28P46779 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL28P46779 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL28P46779 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL28P46779 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL28P46779 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL28P46779 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL28P46779 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL28P46779 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL28P46779 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL28P46779 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL28P46779 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL28P46779 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL28P46779 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL28P46779 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL28P46779 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL28P46779 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL28P46779 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL28P46779 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL28P46779 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL28P46779 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL28P46779 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RPL28P46779 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RPL28P46779 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RPL28P46779 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RPL28P46779 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RPL28P46779 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL28P46779 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL28P46779 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL28P46779 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL28P46779 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL28P46779 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL28P46779 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL28P46779 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL28P46779 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL28P46779 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL28P46779 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL28P46779 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL28P46779 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL28P46779 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL28P46779 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL28P46779 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL28P46779 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL28P46779 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL28P46779 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL28P46779 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL28P46779 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL28P46779 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL28P46779 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL28P46779 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL28P46779 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL28P46779 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL28P46779 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL28P46779 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL28P46779 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL28P46779 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL28P46779 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL28P46779 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RPL28P46779 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RPL28P46779 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL28P46779 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RPL28P46779 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL28P46779 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL28P46779 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL28P46779 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL28P46779 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL28P46779 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL28P46779 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL28P46779 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL28P46779 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL28P46779 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL28P46779 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL28P46779 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL28P46779 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL28P46779 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL28P46779 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL28P46779 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL28P46779 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL28P46779 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL28P46779 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL28P46779 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL28P46779 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL28P46779 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL28P46779 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL28P46779 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL28P46779 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL28P46779 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL28P46779 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RPL28P46779 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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