Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR1P43307 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR1P43307 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR1P43307 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR1P43307 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR1P43307 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR1P43307 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR1P43307 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR1P43307 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR1P43307 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR1P43307 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR1P43307 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR1P43307 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR1P43307 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR1P43307 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR1P43307 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR1P43307 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR1P43307 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR1P43307 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR1P43307 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR1P43307 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR1P43307 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR1P43307 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR1P43307 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR1P43307 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR1P43307 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR1P43307 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SSR1P43307 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSR1P43307 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSR1P43307 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSR1P43307 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSR1P43307 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSR1P43307 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSR1P43307 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSR1P43307 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSR1P43307 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSR1P43307 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSR1P43307 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSR1P43307 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSR1P43307 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSR1P43307 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSR1P43307 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSR1P43307 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSR1P43307 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSR1P43307 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR1P43307 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR1P43307 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR1P43307 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR1P43307 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR1P43307 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR1P43307 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR1P43307 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR1P43307 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR1P43307 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR1P43307 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR1P43307 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR1P43307 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR1P43307 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSR1P43307 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR1P43307 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR1P43307 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR1P43307 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR1P43307 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR1P43307 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR1P43307 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR1P43307 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR1P43307 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR1P43307 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR1P43307 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSR1P43307 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSR1P43307 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SSR1P43307 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSR1P43307 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SSR1P43307 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SSR1P43307 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSR1P43307 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSR1P43307 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSR1P43307 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSR1P43307 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSR1P43307 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSR1P43307 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSR1P43307 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSR1P43307 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR1P43307 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR1P43307 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR1P43307 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR1P43307 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR1P43307 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR1P43307 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR1P43307 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR1P43307 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR1P43307 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR1P43307 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR1P43307 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR1P43307 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR1P43307 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR1P43307 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR1P43307 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR1P43307 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSR1P43307 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms