Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCAMP43121 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCAMP43121 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCAMP43121 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCAMP43121 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCAMP43121 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCAMP43121 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCAMP43121 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCAMP43121 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCAMP43121 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MCAMP43121 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCAMP43121 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCAMP43121 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCAMP43121 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCAMP43121 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCAMP43121 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCAMP43121 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCAMP43121 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCAMP43121 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCAMP43121 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCAMP43121 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCAMP43121 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCAMP43121 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCAMP43121 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCAMP43121 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCAMP43121 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCAMP43121 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCAMP43121 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCAMP43121 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCAMP43121 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCAMP43121 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCAMP43121 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCAMP43121 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCAMP43121 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCAMP43121 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
MCAMP43121 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MCAMP43121 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCAMP43121 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCAMP43121 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCAMP43121 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCAMP43121 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCAMP43121 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCAMP43121 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCAMP43121 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MCAMP43121 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCAMP43121 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MCAMP43121 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MCAMP43121 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCAMP43121 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCAMP43121 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCAMP43121 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCAMP43121 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCAMP43121 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCAMP43121 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MCAMP43121 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCAMP43121 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MCAMP43121 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCAMP43121 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MCAMP43121 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCAMP43121 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCAMP43121 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCAMP43121 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCAMP43121 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCAMP43121 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCAMP43121 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCAMP43121 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCAMP43121 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCAMP43121 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCAMP43121 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCAMP43121 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCAMP43121 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCAMP43121 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCAMP43121 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCAMP43121 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCAMP43121 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCAMP43121 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCAMP43121 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCAMP43121 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCAMP43121 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCAMP43121 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCAMP43121 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCAMP43121 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCAMP43121 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCAMP43121 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCAMP43121 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCAMP43121 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCAMP43121 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCAMP43121 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCAMP43121 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCAMP43121 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCAMP43121 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCAMP43121 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MCAMP43121 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCAMP43121 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCAMP43121 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCAMP43121 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCAMP43121 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCAMP43121 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCAMP43121 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCAMP43121 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms