Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF5P43026 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF5P43026 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF5P43026 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF5P43026 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF5P43026 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF5P43026 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF5P43026 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF5P43026 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF5P43026 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF5P43026 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF5P43026 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF5P43026 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF5P43026 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF5P43026 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF5P43026 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF5P43026 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF5P43026 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF5P43026 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF5P43026 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF5P43026 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF5P43026 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF5P43026 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF5P43026 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF5P43026 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF5P43026 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF5P43026 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF5P43026 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF5P43026 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF5P43026 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF5P43026 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF5P43026 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF5P43026 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF5P43026 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF5P43026 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF5P43026 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF5P43026 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF5P43026 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF5P43026 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF5P43026 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF5P43026 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF5P43026 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF5P43026 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF5P43026 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF5P43026 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF5P43026 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF5P43026 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF5P43026 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF5P43026 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF5P43026 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF5P43026 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF5P43026 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF5P43026 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF5P43026 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF5P43026 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF5P43026 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF5P43026 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF5P43026 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF5P43026 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF5P43026 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF5P43026 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF5P43026 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF5P43026 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF5P43026 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF5P43026 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF5P43026 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF5P43026 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF5P43026 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF5P43026 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF5P43026 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF5P43026 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF5P43026 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF5P43026 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF5P43026 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF5P43026 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF5P43026 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF5P43026 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF5P43026 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF5P43026 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDF5P43026 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF5P43026 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF5P43026 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF5P43026 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF5P43026 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF5P43026 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF5P43026 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF5P43026 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF5P43026 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF5P43026 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF5P43026 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF5P43026 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF5P43026 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF5P43026 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF5P43026 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF5P43026 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF5P43026 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDF5P43026 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GDF5P43026 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GDF5P43026 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GDF5P43026 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms