Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC1A2P43004 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC1A2P43004 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC1A2P43004 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC1A2P43004 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC1A2P43004 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC1A2P43004 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC1A2P43004 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC1A2P43004 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC1A2P43004 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC1A2P43004 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC1A2P43004 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC1A2P43004 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC1A2P43004 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC1A2P43004 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC1A2P43004 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC1A2P43004 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC1A2P43004 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC1A2P43004 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC1A2P43004 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC1A2P43004 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC1A2P43004 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC1A2P43004 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms