Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNFSF9P41273 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFSF9P41273 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF9P41273 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms