Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPHP41219 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPHP41219 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPHP41219 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPHP41219 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPHP41219 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPHP41219 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPHP41219 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPHP41219 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPHP41219 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPHP41219 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPHP41219 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPHP41219 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPHP41219 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPHP41219 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPHP41219 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPHP41219 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPHP41219 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPHP41219 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPHP41219 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPHP41219 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPHP41219 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPHP41219 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPHP41219 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPHP41219 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPHP41219 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPHP41219 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPHP41219 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPHP41219 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPHP41219 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPHP41219 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPHP41219 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPHP41219 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPHP41219 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPHP41219 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPHP41219 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPHP41219 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPHP41219 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPHP41219 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPHP41219 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPHP41219 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPHP41219 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPHP41219 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPHP41219 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPHP41219 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPHP41219 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPHP41219 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPHP41219 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPHP41219 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPHP41219 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPHP41219 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPHP41219 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPHP41219 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPHP41219 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPHP41219 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPHP41219 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPHP41219 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPHP41219 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPHP41219 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPHP41219 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPHP41219 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPHP41219 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPHP41219 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPHP41219 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPHP41219 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPHP41219 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPHP41219 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPHP41219 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRPHP41219 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRPHP41219 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPHP41219 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPHP41219 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPHP41219 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPHP41219 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPHP41219 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPHP41219 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPHP41219 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPHP41219 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPHP41219 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPHP41219 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPHP41219 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPHP41219 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPHP41219 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPHP41219 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPHP41219 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPHP41219 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPHP41219 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPHP41219 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPHP41219 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPHP41219 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPHP41219 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPHP41219 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPHP41219 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPHP41219 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPHP41219 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPHP41219 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPHP41219 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPHP41219 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPHP41219 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPHP41219 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms