Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX2P40425 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX2P40425 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX2P40425 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX2P40425 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX2P40425 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX2P40425 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX2P40425 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX2P40425 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX2P40425 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PBX2P40425 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX2P40425 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX2P40425 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX2P40425 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX2P40425 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX2P40425 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX2P40425 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX2P40425 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX2P40425 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX2P40425 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX2P40425 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX2P40425 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX2P40425 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PBX2P40425 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PBX2P40425 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PBX2P40425 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PBX2P40425 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PBX2P40425 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PBX2P40425 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PBX2P40425 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PBX2P40425 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PBX2P40425 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PBX2P40425 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PBX2P40425 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PBX2P40425 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PBX2P40425 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX2P40425 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX2P40425 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX2P40425 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX2P40425 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX2P40425 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX2P40425 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX2P40425 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX2P40425 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX2P40425 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX2P40425 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX2P40425 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX2P40425 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX2P40425 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX2P40425 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX2P40425 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX2P40425 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX2P40425 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX2P40425 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX2P40425 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX2P40425 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PBX2P40425 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PBX2P40425 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PBX2P40425 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PBX2P40425 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PBX2P40425 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PBX2P40425 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PBX2P40425 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PBX2P40425 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PBX2P40425 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PBX2P40425 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PBX2P40425 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PBX2P40425 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PBX2P40425 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PBX2P40425 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PBX2P40425 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PBX2P40425 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PBX2P40425 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PBX2P40425 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PBX2P40425 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PBX2P40425 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PBX2P40425 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PBX2P40425 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PBX2P40425 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PBX2P40425 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PBX2P40425 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX2P40425 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX2P40425 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX2P40425 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX2P40425 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX2P40425 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX2P40425 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX2P40425 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX2P40425 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX2P40425 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX2P40425 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PBX2P40425 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX2P40425 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX2P40425 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX2P40425 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX2P40425 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX2P40425 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX2P40425 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX2P40425 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PBX2P40425 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms