Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THPOP40225 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THPOP40225 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
THPOP40225 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THPOP40225 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THPOP40225 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THPOP40225 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THPOP40225 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THPOP40225 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THPOP40225 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THPOP40225 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THPOP40225 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THPOP40225 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
THPOP40225 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THPOP40225 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THPOP40225 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THPOP40225 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THPOP40225 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THPOP40225 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THPOP40225 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THPOP40225 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THPOP40225 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THPOP40225 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THPOP40225 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THPOP40225 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THPOP40225 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THPOP40225 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THPOP40225 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THPOP40225 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THPOP40225 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THPOP40225 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THPOP40225 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THPOP40225 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THPOP40225 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THPOP40225 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THPOP40225 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THPOP40225 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THPOP40225 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THPOP40225 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THPOP40225 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THPOP40225 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THPOP40225 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THPOP40225 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THPOP40225 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THPOP40225 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THPOP40225 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THPOP40225 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THPOP40225 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THPOP40225 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THPOP40225 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THPOP40225 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THPOP40225 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THPOP40225 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THPOP40225 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THPOP40225 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THPOP40225 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THPOP40225 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THPOP40225 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THPOP40225 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THPOP40225 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THPOP40225 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THPOP40225 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THPOP40225 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THPOP40225 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THPOP40225 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THPOP40225 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THPOP40225 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THPOP40225 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THPOP40225 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THPOP40225 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THPOP40225 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THPOP40225 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THPOP40225 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
THPOP40225 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THPOP40225 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THPOP40225 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THPOP40225 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THPOP40225 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THPOP40225 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THPOP40225 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THPOP40225 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THPOP40225 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THPOP40225 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THPOP40225 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THPOP40225 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THPOP40225 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THPOP40225 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THPOP40225 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THPOP40225 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THPOP40225 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THPOP40225 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THPOP40225 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THPOP40225 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THPOP40225 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THPOP40225 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THPOP40225 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THPOP40225 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THPOP40225 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THPOP40225 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THPOP40225 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms