Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPGP40121 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPGP40121 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPGP40121 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPGP40121 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPGP40121 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAPGP40121 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPGP40121 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPGP40121 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPGP40121 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPGP40121 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPGP40121 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPGP40121 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPGP40121 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPGP40121 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPGP40121 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPGP40121 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPGP40121 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CAPGP40121 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPGP40121 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPGP40121 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPGP40121 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPGP40121 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPGP40121 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPGP40121 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPGP40121 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPGP40121 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPGP40121 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPGP40121 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CAPGP40121 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPGP40121 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPGP40121 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPGP40121 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPGP40121 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPGP40121 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPGP40121 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPGP40121 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPGP40121 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPGP40121 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPGP40121 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPGP40121 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPGP40121 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPGP40121 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPGP40121 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPGP40121 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPGP40121 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPGP40121 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPGP40121 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPGP40121 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CAPGP40121 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPGP40121 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPGP40121 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPGP40121 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPGP40121 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPGP40121 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPGP40121 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPGP40121 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CAPGP40121 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPGP40121 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPGP40121 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPGP40121 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPGP40121 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPGP40121 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPGP40121 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPGP40121 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPGP40121 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPGP40121 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPGP40121 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPGP40121 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPGP40121 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPGP40121 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPGP40121 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPGP40121 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPGP40121 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPGP40121 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CAPGP40121 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPGP40121 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPGP40121 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPGP40121 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPGP40121 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPGP40121 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPGP40121 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPGP40121 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPGP40121 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPGP40121 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPGP40121 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPGP40121 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPGP40121 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPGP40121 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPGP40121 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPGP40121 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPGP40121 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPGP40121 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPGP40121 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CAPGP40121 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPGP40121 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPGP40121 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPGP40121 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPGP40121 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CAPGP40121 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms