Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ZEB1P37275 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZEB1P37275 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms