Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN2P35609 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms