Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.56
SCN4AP35499 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
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