Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXC12P31275 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXC12P31275 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms