Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DUSP1P28562 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP1P28562 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms