Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSMA3P25788 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms