Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT1P21579 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT1P21579 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT1P21579 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT1P21579 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT1P21579 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT1P21579 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT1P21579 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT1P21579 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT1P21579 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT1P21579 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT1P21579 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT1P21579 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT1P21579 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT1P21579 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT1P21579 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT1P21579 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT1P21579 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT1P21579 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT1P21579 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT1P21579 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT1P21579 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT1P21579 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT1P21579 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT1P21579 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT1P21579 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT1P21579 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT1P21579 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT1P21579 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT1P21579 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT1P21579 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT1P21579 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT1P21579 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT1P21579 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT1P21579 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT1P21579 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT1P21579 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT1P21579 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT1P21579 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT1P21579 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT1P21579 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT1P21579 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT1P21579 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT1P21579 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT1P21579 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT1P21579 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT1P21579 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT1P21579 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT1P21579 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT1P21579 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT1P21579 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT1P21579 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT1P21579 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT1P21579 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT1P21579 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT1P21579 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT1P21579 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT1P21579 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYT1P21579 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYT1P21579 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYT1P21579 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYT1P21579 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYT1P21579 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYT1P21579 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYT1P21579 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYT1P21579 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYT1P21579 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYT1P21579 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYT1P21579 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYT1P21579 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYT1P21579 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYT1P21579 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT1P21579 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT1P21579 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT1P21579 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT1P21579 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT1P21579 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT1P21579 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT1P21579 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT1P21579 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT1P21579 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT1P21579 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT1P21579 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT1P21579 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT1P21579 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT1P21579 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT1P21579 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT1P21579 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT1P21579 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT1P21579 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT1P21579 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT1P21579 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT1P21579 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT1P21579 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT1P21579 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT1P21579 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT1P21579 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT1P21579 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT1P21579 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYT1P21579 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms