Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACO1P21399 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACO1P21399 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACO1P21399 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACO1P21399 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACO1P21399 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACO1P21399 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACO1P21399 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACO1P21399 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACO1P21399 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACO1P21399 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACO1P21399 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACO1P21399 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACO1P21399 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACO1P21399 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACO1P21399 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACO1P21399 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACO1P21399 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACO1P21399 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACO1P21399 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACO1P21399 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACO1P21399 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACO1P21399 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACO1P21399 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACO1P21399 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACO1P21399 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACO1P21399 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACO1P21399 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACO1P21399 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACO1P21399 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACO1P21399 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACO1P21399 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACO1P21399 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACO1P21399 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACO1P21399 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACO1P21399 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACO1P21399 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACO1P21399 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACO1P21399 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACO1P21399 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACO1P21399 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACO1P21399 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACO1P21399 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACO1P21399 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACO1P21399 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACO1P21399 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACO1P21399 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACO1P21399 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACO1P21399 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACO1P21399 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACO1P21399 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACO1P21399 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACO1P21399 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACO1P21399 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACO1P21399 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACO1P21399 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACO1P21399 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACO1P21399 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACO1P21399 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACO1P21399 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACO1P21399 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACO1P21399 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACO1P21399 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACO1P21399 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACO1P21399 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACO1P21399 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACO1P21399 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACO1P21399 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACO1P21399 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACO1P21399 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACO1P21399 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACO1P21399 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACO1P21399 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACO1P21399 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACO1P21399 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACO1P21399 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACO1P21399 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACO1P21399 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACO1P21399 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACO1P21399 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACO1P21399 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACO1P21399 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACO1P21399 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACO1P21399 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACO1P21399 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACO1P21399 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACO1P21399 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACO1P21399 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACO1P21399 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACO1P21399 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACO1P21399 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACO1P21399 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACO1P21399 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACO1P21399 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACO1P21399 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACO1P21399 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACO1P21399 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACO1P21399 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACO1P21399 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACO1P21399 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms