Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD58P19256 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD58P19256 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD58P19256 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CD58P19256 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD58P19256 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD58P19256 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD58P19256 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD58P19256 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD58P19256 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD58P19256 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD58P19256 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD58P19256 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD58P19256 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD58P19256 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD58P19256 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD58P19256 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD58P19256 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD58P19256 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD58P19256 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD58P19256 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD58P19256 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD58P19256 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD58P19256 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD58P19256 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD58P19256 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD58P19256 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD58P19256 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD58P19256 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD58P19256 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD58P19256 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD58P19256 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD58P19256 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD58P19256 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD58P19256 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD58P19256 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD58P19256 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD58P19256 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD58P19256 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD58P19256 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD58P19256 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD58P19256 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD58P19256 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD58P19256 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD58P19256 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD58P19256 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD58P19256 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD58P19256 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD58P19256 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD58P19256 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD58P19256 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD58P19256 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD58P19256 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD58P19256 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD58P19256 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD58P19256 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD58P19256 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD58P19256 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD58P19256 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD58P19256 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CD58P19256 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD58P19256 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD58P19256 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD58P19256 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD58P19256 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CD58P19256 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD58P19256 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD58P19256 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD58P19256 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD58P19256 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD58P19256 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD58P19256 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD58P19256 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD58P19256 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD58P19256 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD58P19256 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD58P19256 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD58P19256 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD58P19256 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD58P19256 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD58P19256 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD58P19256 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD58P19256 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD58P19256 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD58P19256 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD58P19256 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD58P19256 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD58P19256 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD58P19256 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD58P19256 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD58P19256 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD58P19256 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD58P19256 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD58P19256 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD58P19256 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD58P19256 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD58P19256 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD58P19256 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD58P19256 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD58P19256 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms