Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7P17544 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7P17544 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7P17544 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7P17544 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7P17544 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7P17544 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7P17544 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7P17544 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7P17544 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7P17544 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7P17544 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7P17544 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7P17544 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7P17544 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7P17544 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATF7P17544 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF7P17544 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF7P17544 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF7P17544 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF7P17544 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF7P17544 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF7P17544 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF7P17544 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF7P17544 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF7P17544 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF7P17544 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF7P17544 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF7P17544 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF7P17544 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF7P17544 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATF7P17544 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF7P17544 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF7P17544 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF7P17544 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF7P17544 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF7P17544 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF7P17544 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF7P17544 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF7P17544 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF7P17544 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF7P17544 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF7P17544 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF7P17544 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF7P17544 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF7P17544 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF7P17544 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF7P17544 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF7P17544 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF7P17544 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF7P17544 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF7P17544 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATF7P17544 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF7P17544 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF7P17544 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF7P17544 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF7P17544 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF7P17544 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF7P17544 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF7P17544 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF7P17544 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF7P17544 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF7P17544 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF7P17544 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF7P17544 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF7P17544 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATF7P17544 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATF7P17544 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATF7P17544 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATF7P17544 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF7P17544 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF7P17544 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF7P17544 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF7P17544 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF7P17544 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF7P17544 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF7P17544 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF7P17544 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF7P17544 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATF7P17544 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF7P17544 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF7P17544 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF7P17544 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF7P17544 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF7P17544 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF7P17544 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF7P17544 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF7P17544 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF7P17544 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF7P17544 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF7P17544 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF7P17544 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF7P17544 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF7P17544 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF7P17544 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF7P17544 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF7P17544 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF7P17544 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF7P17544 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF7P17544 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms