Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPCAMP16422 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPCAMP16422 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms