Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DOBP13765 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms