Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM17P0DL12 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms