Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M4

RHOXF2B, Rhox homeobox family member 2B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2BP0C7M4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RHOXF2BP0C7M4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2BP0C7M4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2BP0C7M4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2BP0C7M4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2BP0C7M4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2BP0C7M4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2BP0C7M4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2BP0C7M4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2BP0C7M4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2BP0C7M4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2BP0C7M4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2BP0C7M4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2BP0C7M4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2BP0C7M4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2BP0C7M4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2BP0C7M4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2BP0C7M4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2BP0C7M4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2BP0C7M4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2BP0C7M4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOXF2BP0C7M4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2BP0C7M4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2BP0C7M4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2BP0C7M4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2BP0C7M4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOXF2BP0C7M4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms