Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOP08100 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOP08100 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOP08100 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOP08100 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOP08100 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOP08100 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOP08100 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOP08100 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOP08100 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOP08100 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOP08100 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOP08100 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOP08100 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOP08100 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOP08100 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOP08100 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOP08100 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOP08100 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOP08100 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOP08100 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOP08100 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOP08100 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOP08100 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOP08100 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOP08100 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOP08100 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOP08100 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOP08100 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOP08100 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOP08100 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOP08100 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOP08100 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOP08100 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOP08100 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOP08100 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOP08100 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOP08100 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOP08100 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOP08100 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOP08100 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOP08100 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOP08100 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOP08100 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOP08100 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOP08100 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOP08100 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOP08100 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOP08100 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOP08100 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOP08100 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOP08100 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOP08100 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOP08100 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOP08100 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOP08100 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOP08100 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOP08100 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOP08100 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOP08100 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOP08100 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOP08100 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOP08100 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RHOP08100 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RHOP08100 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RHOP08100 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOP08100 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOP08100 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOP08100 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOP08100 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOP08100 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOP08100 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOP08100 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOP08100 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOP08100 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOP08100 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOP08100 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOP08100 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOP08100 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOP08100 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOP08100 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOP08100 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOP08100 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOP08100 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOP08100 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOP08100 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOP08100 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOP08100 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOP08100 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOP08100 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOP08100 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOP08100 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOP08100 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOP08100 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOP08100 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOP08100 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOP08100 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOP08100 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOP08100 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOP08100 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms