Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSN3P07498 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSN3P07498 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSN3P07498 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSN3P07498 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSN3P07498 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSN3P07498 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSN3P07498 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSN3P07498 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSN3P07498 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSN3P07498 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSN3P07498 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSN3P07498 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSN3P07498 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSN3P07498 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSN3P07498 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSN3P07498 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSN3P07498 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSN3P07498 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSN3P07498 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSN3P07498 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSN3P07498 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSN3P07498 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSN3P07498 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSN3P07498 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSN3P07498 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSN3P07498 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSN3P07498 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSN3P07498 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSN3P07498 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSN3P07498 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSN3P07498 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSN3P07498 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSN3P07498 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSN3P07498 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSN3P07498 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSN3P07498 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CSN3P07498 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CSN3P07498 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSN3P07498 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSN3P07498 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSN3P07498 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSN3P07498 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSN3P07498 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSN3P07498 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSN3P07498 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSN3P07498 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSN3P07498 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSN3P07498 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSN3P07498 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSN3P07498 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSN3P07498 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSN3P07498 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSN3P07498 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSN3P07498 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSN3P07498 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSN3P07498 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSN3P07498 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSN3P07498 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSN3P07498 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSN3P07498 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSN3P07498 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSN3P07498 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSN3P07498 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSN3P07498 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSN3P07498 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSN3P07498 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSN3P07498 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSN3P07498 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSN3P07498 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSN3P07498 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSN3P07498 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSN3P07498 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSN3P07498 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSN3P07498 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CSN3P07498 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CSN3P07498 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSN3P07498 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSN3P07498 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSN3P07498 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSN3P07498 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSN3P07498 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSN3P07498 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSN3P07498 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSN3P07498 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSN3P07498 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms