Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLK3P07288 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLK3P07288 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLK3P07288 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLK3P07288 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLK3P07288 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLK3P07288 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLK3P07288 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLK3P07288 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLK3P07288 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLK3P07288 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLK3P07288 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLK3P07288 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLK3P07288 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLK3P07288 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLK3P07288 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLK3P07288 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLK3P07288 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLK3P07288 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLK3P07288 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLK3P07288 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLK3P07288 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLK3P07288 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLK3P07288 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLK3P07288 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLK3P07288 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLK3P07288 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLK3P07288 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLK3P07288 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLK3P07288 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KLK3P07288 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLK3P07288 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLK3P07288 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLK3P07288 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLK3P07288 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLK3P07288 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLK3P07288 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLK3P07288 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLK3P07288 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLK3P07288 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLK3P07288 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLK3P07288 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLK3P07288 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLK3P07288 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLK3P07288 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLK3P07288 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLK3P07288 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLK3P07288 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLK3P07288 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLK3P07288 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLK3P07288 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLK3P07288 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLK3P07288 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLK3P07288 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLK3P07288 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLK3P07288 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLK3P07288 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLK3P07288 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLK3P07288 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLK3P07288 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLK3P07288 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLK3P07288 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLK3P07288 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLK3P07288 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLK3P07288 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLK3P07288 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLK3P07288 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLK3P07288 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLK3P07288 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLK3P07288 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLK3P07288 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLK3P07288 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLK3P07288 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLK3P07288 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.6 ms