Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CENPBP07199 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CENPBP07199 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPBP07199 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPBP07199 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPBP07199 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPBP07199 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPBP07199 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPBP07199 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPBP07199 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPBP07199 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPBP07199 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPBP07199 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPBP07199 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPBP07199 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPBP07199 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPBP07199 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPBP07199 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPBP07199 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPBP07199 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPBP07199 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPBP07199 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPBP07199 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPBP07199 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPBP07199 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPBP07199 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPBP07199 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPBP07199 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPBP07199 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPBP07199 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPBP07199 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPBP07199 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPBP07199 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPBP07199 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPBP07199 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPBP07199 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPBP07199 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPBP07199 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPBP07199 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPBP07199 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPBP07199 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPBP07199 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPBP07199 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPBP07199 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPBP07199 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPBP07199 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPBP07199 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPBP07199 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPBP07199 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPBP07199 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPBP07199 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPBP07199 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPBP07199 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPBP07199 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPBP07199 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPBP07199 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPBP07199 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPBP07199 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPBP07199 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPBP07199 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPBP07199 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPBP07199 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPBP07199 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPBP07199 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPBP07199 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPBP07199 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPBP07199 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPBP07199 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPBP07199 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPBP07199 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPBP07199 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPBP07199 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPBP07199 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPBP07199 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPBP07199 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPBP07199 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPBP07199 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPBP07199 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPBP07199 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPBP07199 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPBP07199 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPBP07199 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPBP07199 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPBP07199 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPBP07199 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPBP07199 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPBP07199 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPBP07199 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPBP07199 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPBP07199 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPBP07199 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPBP07199 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPBP07199 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPBP07199 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPBP07199 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPBP07199 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPBP07199 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPBP07199 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPBP07199 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPBP07199 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms