Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPN1P04843 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPN1P04843 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPN1P04843 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPN1P04843 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPN1P04843 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPN1P04843 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPN1P04843 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPN1P04843 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPN1P04843 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPN1P04843 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPN1P04843 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPN1P04843 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPN1P04843 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPN1P04843 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPN1P04843 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPN1P04843 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPN1P04843 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPN1P04843 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPN1P04843 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPN1P04843 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPN1P04843 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPN1P04843 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPN1P04843 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPN1P04843 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPN1P04843 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPN1P04843 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPN1P04843 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPN1P04843 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPN1P04843 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPN1P04843 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPN1P04843 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPN1P04843 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPN1P04843 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPN1P04843 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPN1P04843 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPN1P04843 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPN1P04843 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPN1P04843 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPN1P04843 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPN1P04843 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPN1P04843 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPN1P04843 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPN1P04843 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPN1P04843 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPN1P04843 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPN1P04843 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPN1P04843 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPN1P04843 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPN1P04843 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPN1P04843 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPN1P04843 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPN1P04843 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPN1P04843 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN1P04843 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN1P04843 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN1P04843 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN1P04843 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN1P04843 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN1P04843 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN1P04843 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN1P04843 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN1P04843 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN1P04843 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN1P04843 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN1P04843 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN1P04843 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN1P04843 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN1P04843 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN1P04843 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN1P04843 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN1P04843 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN1P04843 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPN1P04843 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPN1P04843 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPN1P04843 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPN1P04843 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPN1P04843 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPN1P04843 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RPN1P04843 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPN1P04843 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPN1P04843 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RPN1P04843 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPN1P04843 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPN1P04843 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPN1P04843 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RPN1P04843 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPN1P04843 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPN1P04843 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPN1P04843 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPN1P04843 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPN1P04843 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPN1P04843 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPN1P04843 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPN1P04843 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPN1P04843 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPN1P04843 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPN1P04843 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPN1P04843 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPN1P04843 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms