Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRM2P04554 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRM2P04554 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRM2P04554 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRM2P04554 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRM2P04554 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRM2P04554 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRM2P04554 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRM2P04554 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRM2P04554 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRM2P04554 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRM2P04554 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRM2P04554 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRM2P04554 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRM2P04554 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRM2P04554 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRM2P04554 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRM2P04554 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRM2P04554 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRM2P04554 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRM2P04554 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRM2P04554 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRM2P04554 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRM2P04554 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRM2P04554 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRM2P04554 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRM2P04554 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRM2P04554 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRM2P04554 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRM2P04554 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRM2P04554 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRM2P04554 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRM2P04554 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRM2P04554 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRM2P04554 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRM2P04554 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRM2P04554 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRM2P04554 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRM2P04554 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRM2P04554 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRM2P04554 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRM2P04554 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRM2P04554 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRM2P04554 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRM2P04554 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRM2P04554 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRM2P04554 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRM2P04554 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRM2P04554 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRM2P04554 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PRM2P04554 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRM2P04554 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRM2P04554 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRM2P04554 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRM2P04554 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRM2P04554 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRM2P04554 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRM2P04554 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRM2P04554 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRM2P04554 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRM2P04554 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRM2P04554 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRM2P04554 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRM2P04554 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRM2P04554 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRM2P04554 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRM2P04554 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRM2P04554 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRM2P04554 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRM2P04554 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRM2P04554 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRM2P04554 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRM2P04554 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRM2P04554 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRM2P04554 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRM2P04554 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRM2P04554 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRM2P04554 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRM2P04554 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRM2P04554 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRM2P04554 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRM2P04554 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRM2P04554 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRM2P04554 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRM2P04554 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRM2P04554 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRM2P04554 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRM2P04554 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRM2P04554 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRM2P04554 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRM2P04554 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRM2P04554 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PRM2P04554 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRM2P04554 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRM2P04554 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRM2P04554 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRM2P04554 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRM2P04554 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRM2P04554 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PRM2P04554 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms