Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC1P02654 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC1P02654 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC1P02654 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC1P02654 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC1P02654 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC1P02654 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC1P02654 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC1P02654 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC1P02654 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC1P02654 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC1P02654 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC1P02654 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC1P02654 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC1P02654 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC1P02654 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC1P02654 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC1P02654 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC1P02654 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC1P02654 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC1P02654 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC1P02654 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOC1P02654 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC1P02654 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC1P02654 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC1P02654 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC1P02654 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC1P02654 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC1P02654 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC1P02654 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC1P02654 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC1P02654 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC1P02654 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC1P02654 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC1P02654 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC1P02654 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC1P02654 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC1P02654 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOC1P02654 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC1P02654 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC1P02654 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC1P02654 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC1P02654 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC1P02654 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC1P02654 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC1P02654 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC1P02654 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC1P02654 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC1P02654 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC1P02654 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC1P02654 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC1P02654 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC1P02654 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC1P02654 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC1P02654 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC1P02654 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOC1P02654 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC1P02654 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC1P02654 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC1P02654 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC1P02654 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC1P02654 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC1P02654 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC1P02654 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC1P02654 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC1P02654 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC1P02654 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC1P02654 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC1P02654 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC1P02654 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC1P02654 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC1P02654 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC1P02654 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC1P02654 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC1P02654 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC1P02654 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC1P02654 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC1P02654 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC1P02654 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC1P02654 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC1P02654 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC1P02654 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC1P02654 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC1P02654 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC1P02654 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC1P02654 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC1P02654 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC1P02654 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC1P02654 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC1P02654 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC1P02654 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC1P02654 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC1P02654 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC1P02654 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC1P02654 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC1P02654 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC1P02654 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC1P02654 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC1P02654 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC1P02654 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms