Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOA1P02647 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOA1P02647 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOA1P02647 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOA1P02647 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOA1P02647 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOA1P02647 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOA1P02647 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOA1P02647 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOA1P02647 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOA1P02647 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOA1P02647 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOA1P02647 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOA1P02647 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APOA1P02647 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOA1P02647 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOA1P02647 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOA1P02647 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOA1P02647 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOA1P02647 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOA1P02647 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOA1P02647 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOA1P02647 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOA1P02647 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOA1P02647 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOA1P02647 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOA1P02647 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOA1P02647 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOA1P02647 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOA1P02647 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOA1P02647 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOA1P02647 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOA1P02647 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOA1P02647 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOA1P02647 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOA1P02647 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOA1P02647 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOA1P02647 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOA1P02647 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOA1P02647 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOA1P02647 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOA1P02647 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOA1P02647 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOA1P02647 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
APOA1P02647 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOA1P02647 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOA1P02647 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOA1P02647 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOA1P02647 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOA1P02647 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOA1P02647 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOA1P02647 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOA1P02647 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOA1P02647 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOA1P02647 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOA1P02647 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOA1P02647 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOA1P02647 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOA1P02647 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOA1P02647 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOA1P02647 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APOA1P02647 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOA1P02647 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOA1P02647 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOA1P02647 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOA1P02647 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOA1P02647 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOA1P02647 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOA1P02647 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOA1P02647 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOA1P02647 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOA1P02647 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOA1P02647 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOA1P02647 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOA1P02647 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOA1P02647 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOA1P02647 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOA1P02647 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOA1P02647 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOA1P02647 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOA1P02647 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOA1P02647 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOA1P02647 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOA1P02647 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOA1P02647 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOA1P02647 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOA1P02647 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOA1P02647 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOA1P02647 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOA1P02647 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOA1P02647 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOA1P02647 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOA1P02647 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOA1P02647 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOA1P02647 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOA1P02647 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOA1P02647 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOA1P02647 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOA1P02647 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOA1P02647 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms