Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD3O95983 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD3O95983 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD3O95983 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD3O95983 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD3O95983 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD3O95983 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD3O95983 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD3O95983 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD3O95983 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD3O95983 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD3O95983 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD3O95983 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD3O95983 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD3O95983 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD3O95983 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MBD3O95983 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3O95983 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3O95983 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3O95983 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3O95983 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3O95983 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3O95983 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3O95983 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3O95983 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3O95983 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3O95983 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3O95983 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3O95983 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3O95983 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3O95983 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3O95983 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3O95983 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3O95983 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3O95983 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3O95983 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3O95983 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3O95983 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3O95983 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3O95983 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MBD3O95983 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD3O95983 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD3O95983 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD3O95983 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD3O95983 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD3O95983 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD3O95983 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD3O95983 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MBD3O95983 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD3O95983 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD3O95983 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD3O95983 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD3O95983 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD3O95983 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD3O95983 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD3O95983 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD3O95983 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD3O95983 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD3O95983 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD3O95983 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD3O95983 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD3O95983 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD3O95983 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MBD3O95983 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD3O95983 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD3O95983 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD3O95983 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD3O95983 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MBD3O95983 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD3O95983 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD3O95983 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD3O95983 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD3O95983 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD3O95983 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD3O95983 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD3O95983 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD3O95983 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD3O95983 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD3O95983 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD3O95983 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD3O95983 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD3O95983 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD3O95983 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD3O95983 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD3O95983 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD3O95983 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD3O95983 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD3O95983 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD3O95983 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD3O95983 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD3O95983 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD3O95983 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD3O95983 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD3O95983 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD3O95983 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD3O95983 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD3O95983 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD3O95983 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD3O95983 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD3O95983 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms