Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CBX6O95503 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CBX6O95503 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CBX6O95503 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CBX6O95503 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CBX6O95503 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX6O95503 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX6O95503 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX6O95503 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX6O95503 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX6O95503 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX6O95503 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX6O95503 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX6O95503 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX6O95503 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CBX6O95503 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CBX6O95503 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX6O95503 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX6O95503 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX6O95503 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX6O95503 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX6O95503 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX6O95503 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX6O95503 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX6O95503 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX6O95503 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX6O95503 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX6O95503 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX6O95503 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX6O95503 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX6O95503 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX6O95503 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX6O95503 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX6O95503 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX6O95503 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX6O95503 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CBX6O95503 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX6O95503 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX6O95503 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX6O95503 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX6O95503 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX6O95503 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX6O95503 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX6O95503 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX6O95503 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX6O95503 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX6O95503 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX6O95503 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX6O95503 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX6O95503 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX6O95503 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX6O95503 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CBX6O95503 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX6O95503 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX6O95503 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX6O95503 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX6O95503 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX6O95503 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX6O95503 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX6O95503 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX6O95503 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX6O95503 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX6O95503 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX6O95503 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX6O95503 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX6O95503 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX6O95503 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX6O95503 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX6O95503 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX6O95503 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX6O95503 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX6O95503 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX6O95503 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX6O95503 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX6O95503 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX6O95503 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX6O95503 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CBX6O95503 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX6O95503 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX6O95503 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX6O95503 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX6O95503 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX6O95503 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX6O95503 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX6O95503 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX6O95503 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX6O95503 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX6O95503 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX6O95503 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX6O95503 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CBX6O95503 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX6O95503 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX6O95503 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX6O95503 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX6O95503 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX6O95503 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX6O95503 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX6O95503 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX6O95503 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX6O95503 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms