Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC24BO95487 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC24BO95487 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms