Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB6O95452 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB6O95452 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB6O95452 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB6O95452 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB6O95452 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB6O95452 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB6O95452 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB6O95452 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB6O95452 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB6O95452 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB6O95452 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB6O95452 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB6O95452 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB6O95452 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB6O95452 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB6O95452 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB6O95452 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB6O95452 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB6O95452 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB6O95452 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB6O95452 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB6O95452 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB6O95452 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB6O95452 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB6O95452 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB6O95452 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB6O95452 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB6O95452 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB6O95452 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB6O95452 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB6O95452 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB6O95452 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB6O95452 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB6O95452 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB6O95452 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB6O95452 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB6O95452 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB6O95452 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB6O95452 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB6O95452 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB6O95452 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB6O95452 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB6O95452 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB6O95452 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB6O95452 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB6O95452 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB6O95452 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB6O95452 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB6O95452 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB6O95452 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB6O95452 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB6O95452 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB6O95452 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB6O95452 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB6O95452 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB6O95452 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB6O95452 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB6O95452 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB6O95452 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB6O95452 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB6O95452 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB6O95452 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB6O95452 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB6O95452 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB6O95452 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB6O95452 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB6O95452 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB6O95452 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB6O95452 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB6O95452 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB6O95452 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB6O95452 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB6O95452 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB6O95452 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB6O95452 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB6O95452 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB6O95452 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB6O95452 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB6O95452 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB6O95452 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB6O95452 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB6O95452 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB6O95452 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB6O95452 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB6O95452 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB6O95452 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB6O95452 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB6O95452 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB6O95452 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB6O95452 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB6O95452 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB6O95452 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB6O95452 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB6O95452 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB6O95452 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB6O95452 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB6O95452 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB6O95452 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB6O95452 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms