Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCNDBP1O95273 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCNDBP1O95273 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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