Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBBP9O75884 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBBP9O75884 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms