Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRMUO75648 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRMUO75648 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRMUO75648 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRMUO75648 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRMUO75648 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRMUO75648 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRMUO75648 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRMUO75648 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRMUO75648 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMUO75648 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMUO75648 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMUO75648 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMUO75648 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMUO75648 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMUO75648 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMUO75648 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMUO75648 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMUO75648 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMUO75648 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMUO75648 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMUO75648 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMUO75648 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMUO75648 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMUO75648 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMUO75648 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMUO75648 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRMUO75648 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRMUO75648 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMUO75648 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMUO75648 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMUO75648 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMUO75648 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMUO75648 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMUO75648 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMUO75648 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMUO75648 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMUO75648 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMUO75648 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMUO75648 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMUO75648 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMUO75648 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMUO75648 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMUO75648 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMUO75648 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMUO75648 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMUO75648 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMUO75648 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMUO75648 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMUO75648 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRMUO75648 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRMUO75648 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRMUO75648 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRMUO75648 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRMUO75648 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRMUO75648 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRMUO75648 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRMUO75648 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRMUO75648 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRMUO75648 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRMUO75648 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRMUO75648 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRMUO75648 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRMUO75648 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRMUO75648 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRMUO75648 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRMUO75648 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRMUO75648 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms