Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP9AO75110 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP9AO75110 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms