Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEMFO60524 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEMFO60524 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NEMFO60524 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEMFO60524 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEMFO60524 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEMFO60524 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEMFO60524 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEMFO60524 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEMFO60524 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEMFO60524 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEMFO60524 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEMFO60524 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEMFO60524 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEMFO60524 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEMFO60524 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEMFO60524 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEMFO60524 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEMFO60524 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEMFO60524 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEMFO60524 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEMFO60524 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEMFO60524 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEMFO60524 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEMFO60524 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEMFO60524 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEMFO60524 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEMFO60524 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEMFO60524 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NEMFO60524 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEMFO60524 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEMFO60524 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEMFO60524 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEMFO60524 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEMFO60524 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEMFO60524 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEMFO60524 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEMFO60524 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NEMFO60524 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NEMFO60524 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEMFO60524 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEMFO60524 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEMFO60524 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEMFO60524 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEMFO60524 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEMFO60524 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEMFO60524 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEMFO60524 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEMFO60524 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEMFO60524 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEMFO60524 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEMFO60524 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEMFO60524 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEMFO60524 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEMFO60524 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEMFO60524 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEMFO60524 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEMFO60524 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEMFO60524 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEMFO60524 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMFO60524 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMFO60524 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMFO60524 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMFO60524 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMFO60524 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMFO60524 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMFO60524 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMFO60524 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMFO60524 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMFO60524 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMFO60524 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMFO60524 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMFO60524 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEMFO60524 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMFO60524 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMFO60524 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMFO60524 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMFO60524 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMFO60524 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMFO60524 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMFO60524 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMFO60524 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMFO60524 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMFO60524 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMFO60524 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMFO60524 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEMFO60524 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEMFO60524 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEMFO60524 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEMFO60524 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEMFO60524 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEMFO60524 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEMFO60524 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEMFO60524 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEMFO60524 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEMFO60524 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEMFO60524 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEMFO60524 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEMFO60524 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NEMFO60524 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms