Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP8B3O60423 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8B3O60423 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms