Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRNO43815 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRNO43815 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRNO43815 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRNO43815 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRNO43815 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRNO43815 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRNO43815 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
STRNO43815 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
STRNO43815 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRNO43815 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRNO43815 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRNO43815 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STRNO43815 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRNO43815 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRNO43815 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRNO43815 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRNO43815 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRNO43815 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRNO43815 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRNO43815 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRNO43815 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRNO43815 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRNO43815 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STRNO43815 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRNO43815 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRNO43815 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRNO43815 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRNO43815 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRNO43815 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRNO43815 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRNO43815 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRNO43815 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRNO43815 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRNO43815 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STRNO43815 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRNO43815 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRNO43815 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRNO43815 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRNO43815 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRNO43815 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRNO43815 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRNO43815 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRNO43815 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRNO43815 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRNO43815 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRNO43815 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRNO43815 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRNO43815 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRNO43815 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRNO43815 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRNO43815 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRNO43815 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRNO43815 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRNO43815 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRNO43815 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRNO43815 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRNO43815 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRNO43815 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRNO43815 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRNO43815 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRNO43815 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
STRNO43815 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRNO43815 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRNO43815 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRNO43815 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRNO43815 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRNO43815 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRNO43815 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRNO43815 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRNO43815 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRNO43815 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRNO43815 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRNO43815 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRNO43815 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRNO43815 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRNO43815 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRNO43815 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRNO43815 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRNO43815 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRNO43815 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRNO43815 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRNO43815 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRNO43815 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRNO43815 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRNO43815 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRNO43815 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRNO43815 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRNO43815 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRNO43815 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRNO43815 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
STRNO43815 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRNO43815 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRNO43815 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRNO43815 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
STRNO43815 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRNO43815 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRNO43815 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRNO43815 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRNO43815 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms