Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP290O15078 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP290O15078 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP290O15078 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP290O15078 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP290O15078 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP290O15078 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP290O15078 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP290O15078 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP290O15078 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP290O15078 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP290O15078 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP290O15078 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP290O15078 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP290O15078 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP290O15078 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP290O15078 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP290O15078 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CEP290O15078 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP290O15078 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP290O15078 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP290O15078 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP290O15078 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP290O15078 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP290O15078 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP290O15078 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP290O15078 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP290O15078 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP290O15078 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP290O15078 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP290O15078 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP290O15078 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP290O15078 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP290O15078 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CEP290O15078 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP290O15078 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP290O15078 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP290O15078 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP290O15078 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP290O15078 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP290O15078 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP290O15078 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP290O15078 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP290O15078 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP290O15078 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CEP290O15078 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CEP290O15078 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP290O15078 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP290O15078 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP290O15078 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP290O15078 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP290O15078 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP290O15078 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP290O15078 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP290O15078 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP290O15078 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP290O15078 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP290O15078 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP290O15078 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP290O15078 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP290O15078 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP290O15078 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP290O15078 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP290O15078 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP290O15078 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP290O15078 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP290O15078 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP290O15078 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP290O15078 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP290O15078 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP290O15078 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP290O15078 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP290O15078 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP290O15078 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP290O15078 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP290O15078 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP290O15078 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP290O15078 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP290O15078 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP290O15078 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP290O15078 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP290O15078 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP290O15078 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP290O15078 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP290O15078 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP290O15078 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP290O15078 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP290O15078 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP290O15078 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP290O15078 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP290O15078 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP290O15078 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP290O15078 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP290O15078 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP290O15078 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP290O15078 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP290O15078 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP290O15078 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP290O15078 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP290O15078 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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