Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
SYNJ2O15056 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNJ2O15056 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms