Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2SURPO15042 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2SURPO15042 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2SURPO15042 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
U2SURPO15042 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.58■■■□□ 2
U2SURPO15042 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
U2SURPO15042 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
U2SURPO15042 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2SURPO15042 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
U2SURPO15042 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2SURPO15042 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
U2SURPO15042 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2SURPO15042 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2SURPO15042 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2SURPO15042 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2SURPO15042 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
U2SURPO15042 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2SURPO15042 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
U2SURPO15042 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
U2SURPO15042 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
U2SURPO15042 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
U2SURPO15042 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
U2SURPO15042 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2SURPO15042 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2SURPO15042 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
U2SURPO15042 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
U2SURPO15042 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.56■■■□□ 2
U2SURPO15042 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
U2SURPO15042 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
U2SURPO15042 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
U2SURPO15042 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
U2SURPO15042 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
U2SURPO15042 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2SURPO15042 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2SURPO15042 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
U2SURPO15042 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2SURPO15042 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
U2SURPO15042 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.55■■■□□ 2
U2SURPO15042 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
U2SURPO15042 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.55■■■□□ 2
U2SURPO15042 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
U2SURPO15042 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.55■■■□□ 2
U2SURPO15042 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
U2SURPO15042 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2SURPO15042 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2SURPO15042 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
U2SURPO15042 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
U2SURPO15042 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
U2SURPO15042 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
U2SURPO15042 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
U2SURPO15042 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
U2SURPO15042 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
U2SURPO15042 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
U2SURPO15042 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
U2SURPO15042 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
U2SURPO15042 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
U2SURPO15042 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2SURPO15042 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2SURPO15042 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
U2SURPO15042 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2SURPO15042 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2SURPO15042 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2SURPO15042 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2SURPO15042 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
U2SURPO15042 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.53■■■□□ 2
U2SURPO15042 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
U2SURPO15042 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
U2SURPO15042 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
U2SURPO15042 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2SURPO15042 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2SURPO15042 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2SURPO15042 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2SURPO15042 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2SURPO15042 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2SURPO15042 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
U2SURPO15042 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2SURPO15042 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.52■■■□□ 2
U2SURPO15042 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2SURPO15042 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2SURPO15042 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
U2SURPO15042 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2SURPO15042 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2SURPO15042 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2SURPO15042 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2SURPO15042 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2SURPO15042 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
U2SURPO15042 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
U2SURPO15042 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
U2SURPO15042 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2SURPO15042 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2SURPO15042 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
U2SURPO15042 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
U2SURPO15042 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.52■■■□□ 2
U2SURPO15042 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2SURPO15042 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.52■■■□□ 2
U2SURPO15042 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
U2SURPO15042 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2SURPO15042 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2SURPO15042 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2SURPO15042 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms