Protein–RNA interactions for Protein: O14830

PPEF2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF2O14830 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPEF2O14830 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPEF2O14830 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms