Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTDSP2O14595 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTDSP2O14595 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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