Protein–RNA interactions for Protein: O14576

DYNC1I1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I1O14576 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DYNC1I1O14576 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DYNC1I1O14576 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms