Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRTO14522 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRTO14522 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
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